В связи со спецификой рода своей деятельности АО «Брянскавтодор» большое значение уделяет вопросам охраны окружающей среды. Приоритетными направлениями деятельности природоохранного характера выступает охрана атмосферного воздуха, обращение с отходами производства и потребления, охрана  и рациональное использование земель и недр.

В целях снижения выбросов загрязняющих веществ в атмосферу все АБЗ АО «Брянскавтодор» оснащены газоочистными установками. Выброс вредных веществ осуществляется в строгом соответствии со специальными разрешениями на выброс. Ежегодно в рамках производственного экологического контроля с привлечением сторонних аккредитованных лабораторий осуществляется контроль  соблюдения нормативов выбросов.

Обращение с отходами производства и потребления регламентируется документами  об утверждении нормативов образования отходов и лимитов на их размещение выданными в установленном порядке Управлением Росприроднадзора по Брянской области.

В направлении рационального использования земель и недр АО «Брянскавтодор» проводится работа по геологическому изучению участков недр, согласованию проектов разработки и рекультивации земельных участков, на которых расположены участки недр. После всех работ проводимых на участках недр земельные участки приводятся в состояние пригодное для использования в сельском хозяйстве и других отраслях промышленности.

В собственности АО «Брянскавтодор» находятся 9 повышенных железнодорожных тупиков, позволяющих осуществлять приемку и выгрузку вагонов с сыпучими строительными материалами: щебень всех видов и фракций, отсев из материалов дробления горных пород, песчано-гравийные смеси, соль техническую. Не менее важным является наличие необходимых площадей на территориях тупиков не только для обеспечения складского запаса, но и для возможности хранения поставленного груза.

Адреса расположения железнодорожных тупиков и их вместимость:

Указанные вместимости железнодорожных тупиков позволяют производить разгрузку сыпучих грузов от 600 до 1500 тонн за одну подачу.